组合与自定义¶
完成各示例后,你可以按照以下思路组合脚本,形成适合自身研究的问题驱动流程。
按需挑选模块¶
模型评估 → 调参:先运行 CANN 网络示例 中的 1D/2D CANN 示例,确认参数范围;再切换到 Hebbian 记忆示例 的 Hopfield 例子,对比 Hebb 学习前后的活动特性。
真实轨迹 → 流水线:利用 任务与导航示例 的 import_external_trajectory.py 导入实验路径,保存 为
.npz;随后在 Theta Sweep 流水线示例 中读取并执行 theta sweep 全流程。实验验证:将流水线产生的活动矩阵与 实验数据分析示例 中的 ROI/TDA 分析脚本对照,验证仿真与 实验数据在拓扑结构上的一致性。
快速构建新示例¶
复制模板:从最接近需求的脚本拷贝到
examples/your_topic/。修改配置: - 调整
PlotConfigs、ThetaSweepPipeline等配置字典即可获得新的图像输出。 - 借助uv run python与--help(若脚本支持 argparse)在命令行传参。记录输出:建议在脚本末尾打印生成文件路径,便于自动化流水线上游消费。
常见排错¶
动画生成缓慢: - 降低
time_steps_per_second或fps。 - 在服务器环境中确保安装imageio[ffmpeg]以启用更快的渲染后端。缺少依赖:若看到
ModuleNotFoundError,使用uv add <package>即时补齐;指南各章均注明 额外依赖。数据下载失败:检查网络或预先在本地放置所需数据文件,
load_*系列函数会优先使用本地缓存。
下一步¶
欢迎根据自身课题补充新的示例脚本,并在此指南中追加说明,保持“示例 → 文档”一一对应。
提交 PR 时可参考 docs/zh/examples/index.rst 的列表风格或本章的结构。